MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 chromosome

Total Repeats: 159218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009617	TG	3	6	13	18	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009617	TTTATT	2	12	40	51	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009617	TTTA	2	8	76	83	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009617	TAA	2	6	107	112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009617	TTA	2	6	120	125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009617	AT	3	6	142	147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009617	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009617	AT	3	6	170	175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009617	TA	3	6	177	182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009617	AT	3	6	197	202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009617	TTG	2	6	217	222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009617	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009617	T	7	7	250	256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009617	GGA	2	6	268	273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009617	AGTT	2	8	345	352	25 %	50 %	25 %	0 %	150014893
16	NC_009617	TCT	2	6	391	396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150014893
17	NC_009617	TA	3	6	500	505	50 %	50 %	0 %	0 %	150014893
18	NC_009617	TAT	2	6	516	521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014893
19	NC_009617	AGA	2	6	543	548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
20	NC_009617	TCA	2	6	559	564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014893
21	NC_009617	ATG	2	6	593	598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
22	NC_009617	GTC	2	6	603	608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150014893
23	NC_009617	GTAATA	2	12	650	661	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150014893
24	NC_009617	TGC	2	6	672	677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150014893
25	NC_009617	AT	3	6	727	732	50 %	50 %	0 %	0 %	150014893
26	NC_009617	ATGC	2	8	763	770	25 %	25 %	25 %	25 %	150014893
27	NC_009617	TAA	2	6	848	853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014893
28	NC_009617	GAT	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
29	NC_009617	GAA	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
30	NC_009617	AAAT	2	8	888	895	75 %	25 %	0 %	0 %	150014893
31	NC_009617	CTTA	2	8	912	919	25 %	50 %	0 %	25 %	150014893
32	NC_009617	GAT	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
33	NC_009617	AAG	2	6	959	964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
34	NC_009617	ATG	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
35	NC_009617	ATTAT	2	10	1009	1018	40 %	60 %	0 %	0 %	150014893
36	NC_009617	AGA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
37	NC_009617	A	6	6	1137	1142	100 %	0 %	0 %	0 %	150014893
38	NC_009617	CTA	2	6	1196	1201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014893
39	NC_009617	TAA	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014893
40	NC_009617	AAT	2	6	1245	1250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014893
41	NC_009617	CTC	2	6	1257	1262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150014893
42	NC_009617	TAAC	2	8	1265	1272	50 %	25 %	0 %	25 %	150014893
43	NC_009617	ATA	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014893
44	NC_009617	GAA	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014893
45	NC_009617	GGA	2	6	1510	1515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014893
46	NC_009617	TGA	2	6	1572	1577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014893
47	NC_009617	A	7	7	1608	1614	100 %	0 %	0 %	0 %	150014893
48	NC_009617	TAA	2	6	1644	1649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009617	ATA	2	6	1654	1659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009617	ATA	2	6	1668	1673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009617	T	7	7	1674	1680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009617	TAT	2	6	1686	1691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009617	TTG	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009617	CAA	2	6	1789	1794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009617	CTA	3	9	1806	1814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009617	TTA	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009617	ACT	2	6	1840	1845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009617	ATC	2	6	1850	1855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009617	AATAA	2	10	1869	1878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009617	GGA	2	6	1879	1884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009617	A	6	6	1913	1918	100 %	0 %	0 %	0 %	150014894
62	NC_009617	CAA	2	6	1964	1969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014894
63	NC_009617	TA	3	6	1990	1995	50 %	50 %	0 %	0 %	150014894
64	NC_009617	CAA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014894
65	NC_009617	TAT	2	6	2070	2075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014894
66	NC_009617	GAA	2	6	2077	2082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014894
67	NC_009617	ATA	2	6	2119	2124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
68	NC_009617	TAA	2	6	2174	2179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
69	NC_009617	AT	3	6	2285	2290	50 %	50 %	0 %	0 %	150014894
70	NC_009617	A	6	6	2292	2297	100 %	0 %	0 %	0 %	150014894
71	NC_009617	CTT	2	6	2312	2317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150014894
72	NC_009617	TTC	2	6	2348	2353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150014894
73	NC_009617	ATT	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014894
74	NC_009617	AGA	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014894
75	NC_009617	TAA	2	6	2541	2546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
76	NC_009617	AT	3	6	2549	2554	50 %	50 %	0 %	0 %	150014894
77	NC_009617	ATTTA	2	10	2556	2565	40 %	60 %	0 %	0 %	150014894
78	NC_009617	ATA	2	6	2578	2583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
79	NC_009617	ATT	2	6	2622	2627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014894
80	NC_009617	TAA	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
81	NC_009617	TAA	2	6	2759	2764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
82	NC_009617	GGA	2	6	2877	2882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014894
83	NC_009617	GTT	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150014894
84	NC_009617	GAA	2	6	2932	2937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014894
85	NC_009617	ATA	2	6	2939	2944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014894
86	NC_009617	AGG	2	6	2990	2995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014894
87	NC_009617	ATT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009617	TA	3	6	3016	3021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009617	AATAA	2	10	3031	3040	80 %	20 %	0 %	0 %	150014895
90	NC_009617	T	6	6	3072	3077	0 %	100 %	0 %	0 %	150014895
91	NC_009617	A	6	6	3175	3180	100 %	0 %	0 %	0 %	150014895
92	NC_009617	GTA	2	6	3196	3201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014895
93	NC_009617	ATA	2	6	3226	3231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014895
94	NC_009617	ATT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009617	TATG	2	8	3282	3289	25 %	50 %	25 %	0 %	150014896
96	NC_009617	A	6	6	3325	3330	100 %	0 %	0 %	0 %	150014896
97	NC_009617	TAT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
98	NC_009617	CA	3	6	3434	3439	50 %	0 %	0 %	50 %	150014896
99	NC_009617	TAA	2	6	3461	3466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
100	NC_009617	TAGAT	2	10	3513	3522	40 %	40 %	20 %	0 %	150014896
101	NC_009617	A	7	7	3523	3529	100 %	0 %	0 %	0 %	150014896
102	NC_009617	GTA	2	6	3622	3627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014896
103	NC_009617	AGA	2	6	3639	3644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014896
104	NC_009617	AAG	2	6	3659	3664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014896
105	NC_009617	AAG	3	9	3675	3683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014896
106	NC_009617	ATA	2	6	3743	3748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
107	NC_009617	GAAA	2	8	3760	3767	75 %	0 %	25 %	0 %	150014896
108	NC_009617	TTA	2	6	3772	3777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
109	NC_009617	ATTAT	2	10	3842	3851	40 %	60 %	0 %	0 %	150014896
110	NC_009617	AT	3	6	3867	3872	50 %	50 %	0 %	0 %	150014896
111	NC_009617	AGA	2	6	3927	3932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014896
112	NC_009617	ATT	2	6	3989	3994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
113	NC_009617	A	7	7	3996	4002	100 %	0 %	0 %	0 %	150014896
114	NC_009617	ATA	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
115	NC_009617	GAT	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014896
116	NC_009617	ATA	2	6	4085	4090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
117	NC_009617	ACA	2	6	4119	4124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014896
118	NC_009617	AG	3	6	4171	4176	50 %	0 %	50 %	0 %	150014896
119	NC_009617	TAT	2	6	4196	4201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
120	NC_009617	GAT	2	6	4207	4212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014896
121	NC_009617	A	6	6	4240	4245	100 %	0 %	0 %	0 %	150014896
122	NC_009617	TA	3	6	4246	4251	50 %	50 %	0 %	0 %	150014896
123	NC_009617	TAA	2	6	4280	4285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014896
124	NC_009617	ATT	2	6	4313	4318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014896
125	NC_009617	GAT	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014896
126	NC_009617	AT	3	6	4379	4384	50 %	50 %	0 %	0 %	150014896
127	NC_009617	GTA	2	6	4410	4415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014897
128	NC_009617	ATT	2	6	4431	4436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014897
129	NC_009617	ACAAT	2	10	4476	4485	60 %	20 %	0 %	20 %	150014897
130	NC_009617	AGA	3	9	4499	4507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014897
131	NC_009617	AGAA	2	8	4517	4524	75 %	0 %	25 %	0 %	150014897
132	NC_009617	AGA	2	6	4529	4534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014897
133	NC_009617	ATA	2	6	4567	4572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014897
134	NC_009617	AT	3	6	4581	4586	50 %	50 %	0 %	0 %	150014897
135	NC_009617	ATC	2	6	4598	4603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014897
136	NC_009617	TAA	2	6	4667	4672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009617	TTA	2	6	4676	4681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009617	AGG	2	6	4687	4692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009617	ATG	2	6	4723	4728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
140	NC_009617	TCA	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150014898
141	NC_009617	ATA	2	6	4840	4845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014898
142	NC_009617	TGA	2	6	4850	4855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
143	NC_009617	TAA	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014898
144	NC_009617	GGT	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150014898
145	NC_009617	GGA	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014898
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148	NC_009617	GCA	2	6	5129	5134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150014898
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152	NC_009617	AT	4	8	5304	5311	50 %	50 %	0 %	0 %	150014898
153	NC_009617	TAG	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014898
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163	NC_009617	TTG	2	6	5758	5763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150014898
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176	NC_009617	TAT	2	6	6327	6332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014898
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